まじめちゃんブログ

社会人 x 学生

2022-01-01から1年間の記事一覧

Chapter 3.4 & 3.5

「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」(朝倉書店)を使ってバイオインフォの勉強を進めているところです Chapter 3.4 ゲノムアノテーション・ファイルの解析 Chapter 3.4では、まずGFF (genetic feature format) や GTF (general transfer f…

Chpater 3.3 低品質レファレンスゲノムへの対応策

またもやデータをダウンロードできない事象が発生しました。 Githubで公開されているコード !rm -f atroparvus.fa.gz gambiae.fa.gz 2>/dev/null !wget ftp://ftp.vectorbase.org/public_data/organism_data/agambiae/Genome/agambiae.CHROMOSOMES-PEST.Agam…

はじめに

この記事のテーマ 最近「バイオインフォマティクス Pythonによる実践レシピ」(著・Tiago Antao/訳・阿久津達也、竹本和広/朝倉書店)を使ってバイオインフォの勉強しています。 ↓以下のリンクの本です バイオインフォマティクス: Pythonによる実践レシピ …